银杏树施肥方法和其他果树一样，有土壤施肥和根外追肥之分。土壤施肥既含有机肥，又有无机肥，其中基肥主要是土壤施入。根外追肥以无机肥为主，大多是追肥。土壤施肥又有沟施、穴施、全园撒施等多种方法，根外追肥又根据具体情况确定。
    ①根部施肥：
    a． 沟状施肥：有放射沟、环状沟和条状沟施肥。放射沟施肥，以树干为中心，在冠周围呈放射性开沟，距离主干的内沟浅，深15厘米左右，冠外围至投影处的外沟深，深约40厘米，沟宽40厘米，外沟可适当放宽。肥料放入沟内覆土，开沟位置可隔年或依次更换。这种方式适合成年园施肥。环状沟施肥，是在树冠投影外侧，挖深20厘米、宽40厘米的环状沟，然后施肥再覆土，这种施肥方式适用于幼树，应随树龄的增长逐年外移环状沟，与土壤管理中的深翻扩穴类似，只是施肥需要，大多是结合使用。条状沟施肥则是在树冠外围两侧（东西或南北方向）各挖一条施肥沟。沟的深度和宽度各为40厘米，沟的长度依树冠大小而定，沟挖好后将肥料填入沟内再覆土。条状沟方向可隔年倒换，一般结合深翻进行。
    b． 锥孔施肥：用特制的一种施肥锥，在树冠下均匀打孔，深20厘米或更深，每孔施入人畜粪、饼肥或化肥等。该方法可深施，且不伤根或极少伤根；单位土壤中肥料浓度高，便于渗透及根系吸收；还可以改善根系通气状况，促进跟次生长。
    c． 全园撒施：把肥料均匀地撒在树冠内外，结合松土将肥料翻入土中。密植园根系遍及整个园地，这种施肥方式较合适。如较干旱园地施肥时，需适当灌水。
    ②根外追肥：即叶面喷肥，是在树冠上喷洒液体肥料的一种施肥方法。这种施肥方式适合于：气温回升而地温较低时；土壤干旱、灌水条件差，尤其是对在土壤中易产生生物和化学固定作用的肥料和微量元素；树体缺乏某种元素，特别是微量元素。此外，根外追肥还可提高坐种率、促进种实增大、改善品质，促进花芽分化等优点。
    一般来说在硬核期以前，根外施肥较适宜。为提高吸收率，可在喷肥时加入沾着剂，如加洗衣粉等；喷后遇雨会降低效果，所以，应给予充分考虑。下面介绍一些常见的根外追肥及浓度。
    喷氮 常用浓度0.3%~0.5%尿素。喷后叶色浓率，促进光合作用，延长叶片寿命和活力。还可增加叶面积和叶片厚度。叶喷尿素可每月一次，从4月下旬人工授粉后开始，9~10月止。
    喷钾 常用K2SO4、KNO3和KH2PO4及草木灰浸出液，浓度0.3%~0.5%，分别于5月下旬至6月上旬和7月中、下旬各喷1次，喷钾目的是促进种实生长、种核发育和延缓叶片衰老。也可与尿素交替喷施。
    喷磷 常用过磷酸钙，浓度0.5%~1%。磷在土壤中移动性较小，故根外喷施效果好。从6月中、下旬至8月中旬进行2次，如用KH2PO4，则以0.3%~0.5%浓度为宜。磷可以改善树体内氮素状况，促进碳水化合物运输，促进新根产生及根系生长，磷还可增加体内束缚水及可溶性糖含量，提高银杏的抗逆性。从目前研究状况和生产中看，给树体补充适当的硼对授粉、受精有利；硼可促进花粉萌发和花粉管延伸，在银杏萌芽后、开花前喷1%浓度的硼酸，盛花期和盛花期后各喷一次0.25%~0.5%硼砂，并混加同浓度的石灰水。在缺铁或缺锌时，叶喷0.3%~0.5%硫酸亚铁或0.5%硫酸锌，并与同浓度的石灰水混喷，效果较好。此外，还有喷锰、镁等。